Najvyšší kontrolný úrad zhodnotil, že eurofondy zlepšili infraštruktúru a život na Slovensku, no slabšie podporili inovácie a produktivitu. Hlavný cieľ – zmenšiť rozdiely medzi regiónmi – bol splnený len čiastočne, východ krajiny zostáva hlboko pod priemerom EÚ. Systém čerpania dlhodobo trpí tými istými chybami: byrokraciou, zlým riadením, slabým dohľadom a dobiehaním čerpania na poslednú chvíľu.